首都医科大学的校训是“扶伤济世、敬德修业”。‌校训释义：
“扶伤”出自毛泽东的题词：“救死扶伤，实行革命的人道主义”。“济世”出自医学典故“悬壶济世”。“敬德”、“修业”出自《中庸》“君子尊德性而道问学”；《周易》“君子进德修业”。
扶伤济世是医务工作者的天职，敬德修业是实现扶伤济世的基础。以“扶伤济世，敬德修业”为校训，体现了学校在学科发展和人才培养中的要求，追求“德、业”境界，履行“济世”义务。

吴阶平校训题字
校训体现了首医大办学的理念。

首都医科大学校训石

首都医科大学校训石：位于阶平楼前，首医北门不远处。校训石上携刻有吴阶平老校长的八个金色题字：“扶伤济世、敬德修业”。