南京农业大学分别于2004年3月和2008年9月启动校训和校徽的修订工作，经广泛征集、反复论证、认真修订，并经过2009年1月16日第四届教代会暨第九届工代会审议，通过了新的校训和校徽的定稿方案。
南京农业大学校训为：“诚 朴 勤 仁”，原校训“团结 勤奋 求实 创新”改作校风使用。 新的校徽是在原校徽的基础上修改而成，原校徽不再使用。
校训“诚朴勤仁”，分别从南京农业大学前身中央大学校训“诚朴雄伟”和金陵大学校训“诚真勤仁”中各取二字组合而成，是南京农业大学在百余年办学历程中，秉承中央大学、金陵大学优良传统，逐步形成的具有南农特色的精神品格。

南京农业大学校训：诚朴勤仁书法题字

南京农业大学校训石介绍